(相关资料图)
目前,阿尔茨海默病没有客观、易于评估的诊断标志物,也没有好的治疗选择。采用不可知论的方法,蛋白质组学专家 Hanno Steen 博士和神经生物学家 Judith Steen 博士在波士顿儿童医院共用一个实验室,合作分析来自脑脊液 (CSF) 的蛋白质组学数据大脑,结合来自 10 个不同研究队列的数据,其中大部分已经发表过。
他们的发现发表在Cell Reports Medicine上,可以为公正的测试和可能的新治疗方法提供信息。
合并多个数据集
为了获得更多的统计能力,Steens 和他们的同事对以前的 CSF 蛋白质组学研究进行了荟萃分析。
“许多蛋白质组学研究仅分析非常小的样本集,因此结果不一致,”波士顿儿童医院蛋白质组学中心主任 Hanno Steen 说。“我们说,"让我们将可用数据结合在一起。"”
该团队从 7 项研究中收集的 170 个 CSF 样本中检索了原始质谱数据,这些数据被认为足够强大,可以纳入分析。然后,他们制定了各种步骤,使研究之间的数据更具可比性。
他们的分析产生了 21 种生物标志物,这些生物标志物似乎可以区分患有和未患有阿尔茨海默氏症的人。该团队接下来试图在来自其他三项研究的 494 个脑脊液样本(228 个患有阿尔茨海默氏症,266 个对照)的蛋白质组学数据中验证这些生物标志物。
这个过程淘汰了一些先前报道的生物标志物,并为 Steens 留下了三种重要的蛋白质:参与能量代谢的酶,特别是与葡萄糖分解相关的酶:果糖二磷酸醛缩酶 A、L-乳酸脱氢酶 B 链和丙酮酸激酶。
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